Dragon Ball EX apocalypto se passe après Dragon ball GT. Alors que Vegeta pars s'entraîner sur une autre planète avec Goten, Goku, devenu un dieu, possède sa propre planète. Un jour, il se fait soudainement posséder par un esprit malveillant. Cet esprit, à travers le corps de Goku, détruit la planète Namek, puis s'attaque à la terre. Il part à la recherche de Dende...